MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 3034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009837	ATG	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418084
2	NC_009837	CCT	2	6	81	86	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418084
3	NC_009837	GTG	2	6	104	109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418084
4	NC_009837	CCG	2	6	126	131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418084
5	NC_009837	A	6	6	307	312	100 %	0 %	0 %	0 %	157418085
6	NC_009837	GCTG	2	8	419	426	0 %	25 %	50 %	25 %	157418085
7	NC_009837	GTT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418085
8	NC_009837	CTG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418085
9	NC_009837	GTG	2	6	532	537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418085
10	NC_009837	TGGC	2	8	552	559	0 %	25 %	50 %	25 %	157418085
11	NC_009837	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418085
12	NC_009837	ATG	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229776985
13	NC_009837	AGC	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229776985
14	NC_009837	TCT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229776985
15	NC_009837	ACG	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229776985
16	NC_009837	CCG	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229776985
17	NC_009837	TGC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229776985
18	NC_009837	CCTTC	2	10	1556	1565	0 %	40 %	0 %	60 %	229776985
19	NC_009837	ATT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229776985
20	NC_009837	TGA	2	6	1685	1690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229776985
21	NC_009837	ATG	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229776985
22	NC_009837	TCATTG	2	12	1762	1773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229776985
23	NC_009837	GC	3	6	1777	1782	0 %	0 %	50 %	50 %	229776985
24	NC_009837	TGT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229776985
25	NC_009837	TGC	2	6	1817	1822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229776985
26	NC_009837	CTG	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229776985
27	NC_009837	GTT	2	6	1853	1858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229776985
28	NC_009837	AGTAAT	2	12	1965	1976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	229776985
29	NC_009837	TGGA	2	8	1992	1999	25 %	25 %	50 %	0 %	229776985
30	NC_009837	A	6	6	2036	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	229776985
31	NC_009837	TGT	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229776985
32	NC_009837	TGG	2	6	2304	2309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418087
33	NC_009837	GC	3	6	2321	2326	0 %	0 %	50 %	50 %	157418087
34	NC_009837	GAT	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418087
35	NC_009837	CTT	2	6	2499	2504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418087
36	NC_009837	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418087
37	NC_009837	GCC	2	6	2577	2582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418087
38	NC_009837	GCT	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418087
39	NC_009837	TGGT	2	8	2625	2632	0 %	50 %	50 %	0 %	157418087
40	NC_009837	GAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418087
41	NC_009837	CAA	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418087
42	NC_009837	GAAT	2	8	2734	2741	50 %	25 %	25 %	0 %	157418087
43	NC_009837	GCTG	2	8	2761	2768	0 %	25 %	50 %	25 %	157418087
44	NC_009837	ATT	2	6	2792	2797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418087
45	NC_009837	GTT	2	6	2834	2839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418087
46	NC_009837	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	157418087
47	NC_009837	AGA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418087
48	NC_009837	AGC	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418087
49	NC_009837	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	157418087
50	NC_009837	GAA	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418087
51	NC_009837	TCA	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418087
52	NC_009837	TAGA	2	8	3111	3118	50 %	25 %	25 %	0 %	157418087
53	NC_009837	AG	3	6	3142	3147	50 %	0 %	50 %	0 %	157418087
54	NC_009837	TGCC	2	8	3776	3783	0 %	25 %	25 %	50 %	157418088
55	NC_009837	AGTG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	50 %	0 %	157418088
56	NC_009837	TG	3	6	3790	3795	0 %	50 %	50 %	0 %	157418088
57	NC_009837	TGC	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418088
58	NC_009837	CCGCC	2	10	3850	3859	0 %	0 %	20 %	80 %	157418088
59	NC_009837	GCA	2	6	3916	3921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418088
60	NC_009837	ATG	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418088
61	NC_009837	GAA	2	6	4006	4011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418088
62	NC_009837	AGTT	2	8	4144	4151	25 %	50 %	25 %	0 %	157418089
63	NC_009837	CTT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418089
64	NC_009837	G	7	7	4176	4182	0 %	0 %	100 %	0 %	157418089
65	NC_009837	GTC	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
66	NC_009837	GCG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
67	NC_009837	GCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418089
68	NC_009837	CTG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
69	NC_009837	ATG	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418089
70	NC_009837	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
71	NC_009837	ACT	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418089
72	NC_009837	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418089
73	NC_009837	GGA	2	6	4501	4506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418089
74	NC_009837	T	6	6	4548	4553	0 %	100 %	0 %	0 %	157418089
75	NC_009837	CAT	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418089
76	NC_009837	CTG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
77	NC_009837	GCC	2	6	4884	4889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418089
78	NC_009837	GCG	2	6	4957	4962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
79	NC_009837	CGG	2	6	5003	5008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
80	NC_009837	C	6	6	5097	5102	0 %	0 %	0 %	100 %	157418089
81	NC_009837	AGCC	2	8	5112	5119	25 %	0 %	25 %	50 %	157418089
82	NC_009837	GCA	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418089
83	NC_009837	CGG	3	9	5155	5163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
84	NC_009837	TATGC	2	10	5310	5319	20 %	40 %	20 %	20 %	157418090
85	NC_009837	GGCAC	2	10	5350	5359	20 %	0 %	40 %	40 %	157418090
86	NC_009837	AAC	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418090
87	NC_009837	GGA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418090
88	NC_009837	GTCT	2	8	5447	5454	0 %	50 %	25 %	25 %	157418090
89	NC_009837	A	6	6	5519	5524	100 %	0 %	0 %	0 %	157418090
90	NC_009837	ATG	2	6	5587	5592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418090
91	NC_009837	CAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418090
92	NC_009837	AC	3	6	5737	5742	50 %	0 %	0 %	50 %	157418090
93	NC_009837	GTG	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418091
94	NC_009837	GTT	2	6	6064	6069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418091
95	NC_009837	GGA	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418091
96	NC_009837	TGC	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418091
97	NC_009837	GTGATG	2	12	6148	6159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157418091
98	NC_009837	GAA	2	6	6232	6237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418091
99	NC_009837	GA	3	6	6239	6244	50 %	0 %	50 %	0 %	157418091
100	NC_009837	TTC	3	9	6656	6664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418092
101	NC_009837	TCCTCT	2	12	6669	6680	0 %	50 %	0 %	50 %	157418092
102	NC_009837	GGCGG	2	10	6726	6735	0 %	0 %	80 %	20 %	157418092
103	NC_009837	CGC	2	6	6828	6833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418092
104	NC_009837	CGT	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418092
105	NC_009837	GCG	2	6	6929	6934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418092
106	NC_009837	TGCC	2	8	6948	6955	0 %	25 %	25 %	50 %	157418092
107	NC_009837	CA	3	6	6962	6967	50 %	0 %	0 %	50 %	157418092
108	NC_009837	CCG	2	6	7508	7513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418093
109	NC_009837	GTG	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418093
110	NC_009837	TGA	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418093
111	NC_009837	GCC	2	6	7703	7708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418093
112	NC_009837	GGC	2	6	7717	7722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418093
113	NC_009837	AGC	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418094
114	NC_009837	GCC	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418094
115	NC_009837	CG	3	6	7806	7811	0 %	0 %	50 %	50 %	157418094
116	NC_009837	ACA	2	6	7828	7833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418094
117	NC_009837	TGC	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418094
118	NC_009837	A	6	6	7878	7883	100 %	0 %	0 %	0 %	157418094
119	NC_009837	ATG	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418094
120	NC_009837	ACCGG	2	10	7946	7955	20 %	0 %	40 %	40 %	157418094
121	NC_009837	CTC	2	6	7965	7970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418094
122	NC_009837	GA	3	6	7981	7986	50 %	0 %	50 %	0 %	157418094
123	NC_009837	CGCT	2	8	8005	8012	0 %	25 %	25 %	50 %	157418094
124	NC_009837	TGA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418094
125	NC_009837	GAT	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418094
126	NC_009837	CCCG	2	8	8117	8124	0 %	0 %	25 %	75 %	157418094
127	NC_009837	CGC	2	6	8157	8162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418094
128	NC_009837	CGT	2	6	8166	8171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418094
129	NC_009837	GC	3	6	8247	8252	0 %	0 %	50 %	50 %	157418094
130	NC_009837	CGT	2	6	8301	8306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418094
131	NC_009837	A	7	7	8310	8316	100 %	0 %	0 %	0 %	157418094
132	NC_009837	TCA	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418094
133	NC_009837	A	6	6	8479	8484	100 %	0 %	0 %	0 %	157418094
134	NC_009837	GAAG	2	8	8493	8500	50 %	0 %	50 %	0 %	157418094
135	NC_009837	GAT	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418094
136	NC_009837	CAT	2	6	8531	8536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418094
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138	NC_009837	TCAGCA	2	12	8588	8599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157418094
139	NC_009837	GCG	3	9	8659	8667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418094
140	NC_009837	CAT	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418094
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142	NC_009837	TGT	2	6	8903	8908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418094
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151	NC_009837	CCG	2	6	9512	9517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418095
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249	NC_009837	CATTC	2	10	14391	14400	20 %	40 %	0 %	40 %	157418101
250	NC_009837	TGGCAG	2	12	14519	14530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157418101
251	NC_009837	GCA	2	6	14570	14575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418101
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253	NC_009837	ATT	2	6	14695	14700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418102
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257	NC_009837	TTG	2	6	14792	14797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418102
258	NC_009837	TG	3	6	14804	14809	0 %	50 %	50 %	0 %	157418102
259	NC_009837	AGAA	2	8	14812	14819	75 %	0 %	25 %	0 %	157418102
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261	NC_009837	ACC	2	6	14850	14855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418102
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264	NC_009837	GT	3	6	14969	14974	0 %	50 %	50 %	0 %	157418103
265	NC_009837	GGC	2	6	15052	15057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418103
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285	NC_009837	TCAG	2	8	16179	16186	25 %	25 %	25 %	25 %	157418106
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389	NC_009837	CCGT	2	8	21947	21954	0 %	25 %	25 %	50 %	157418115
390	NC_009837	CGG	2	6	22016	22021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418115
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